Пик риска распространения вируса Нипах в штате приходится на период с апреля по сентябрь, когда обилие сезонных фруктовых деревьев, повышенная активность летучих мышей в поисках корма, сезон размножения летучих мышей и динамика выделения вируса совпадают, что увеличивает риск заражения человека. Эта картина не изменилась в Керале с момента самой первой вспышки.